Morphology and molecular phylogeny of the cave dwelling subgenus Illyrionethes Verhoeff, 1927 (Isopoda, Trichoniscidae) in the Dinaric karst

doctoral thesis

• Title (croatian): Morfologija i molekularna filogenija troglobiontskog podroda Illyrionethes Verhoeff, 1927 (Isopoda, Trichoniscidae) u Dinarskom kršu
• Author: Jana Bedek
• Mentor: Sanja Gottstein (mentor)
• Committee member: Tvrtko Dražina (predsjednik povjerenstva)
• Committee member: Helena Ćetković (član povjerenstva)
• Granter: University of Zagreb; Faculty of Science; (Department of Biology); Zagreb
• Defense date and country: 2019-11-13, Croatia
• Scientific / art field, discipline and subdiscipline: NATURAL SCIENCES; Biology
• Universal decimal classification (UDC): 57 - Biological sciences. Physical anthropology. Biodiversity

Abstract

Podzemni južnoeuropski rod Alpioniscus se sastoji od dva podroda: Alpioniscus s.s. i Illyrionethes
s 33 opisane vrste. Na Dinarskom kršu je bilo zabilježeno ukupno 13 nominalnih te 12 pretpostavljenih neopisanih troglobiontnih vrsta podroda Illyrionethes. Cilj ovog istraživanja bio
je potvrditi nominalne i neopisane vrste dinarskih svojti podroda Illyrionethes, donijeti nove
spoznaje o filogenetskim grupama, njihovim međusobnim odnosima, arealima i ključnim taksonomskim obilježjima za razlučivanje pojedinih vrsta unutar ovog podroda. Provedene su
detaljne taksonomske analize te molekularne analize odsječaka gena podrijetlom iz mitohondrijske DNK (citokrom oksidaza podjedinica I–COI i veća podjedinica ribosomalne RNK–16S) te iz jezgrine DNA (histon H3). Analizirane su sve nominalne te sedam neopisanih vrsta. Rezultati su potvrdili 12 od 13 nominalnih i sve analizirane neopisane vrste. Molekularnom i takosnomskom analizom je utvrđeno kako je nominalna svojta A. bosniensis sinonim imena A. heroldi. Opisano je
sedam novih vrsta: A. iapodicus, A. hirci, A. velebiticus, A. lossinii, A. drazinai, A. mandalinae i
A. busljetai. Rezultat istraživanja je 19 nominalnih vrsta trenutno poznatih s Dinarskog krša.
Grupirale su se u tri filogenetske grupe: strasseri-, heroldi- i magnus-grupa. Areali sve tri grupe se preklapaju te prate sjeverozapadno-jugoistočan smjer pružanja Dinarida. Najpotpunije su
prikupljene jedinke strasseri-grupe, čiji su međusobni odnosi značajno podržani filogenetskim metodama. Stoga su na jedinkama ove linije provedena detaljna taksonomska istraživanja. Nove
morfološke značajke, poput specifičnih omjera dijelova tijela (duljina karpusa i duljina grbe karpusa sedme nožice mužjaka; duljina odsječka i duljina stacionarne točke konkavnosti vanjskog ruba vanjskog odsječka prvog para začane nožice), su predloženi za buduće taksonomsko
određivanje vrsta.

Abstract (english)

The subterranean southern European genus Alpioniscus consists of two subgenera: Alpioniscus s.s. and Illyrionethes, with 33 species described. In Dinaric Karst, 13 nominal and 12 putative undescribed troglobiotic Illyrionethes have been recorded. The aim of the study was to confirm the existence of the nominal and undescribed species of the Dinaric Illyrionethes, bring insights into the phylogenetic groups, their mutual relationships, distributions and differential characters of the species. The molecular analyses using two mtDNA (16S rRNA and COI) and a nuclear gene (H3) fragments have been performed, as well as detailed taxonomical study on all nominal and seven undescribed Dinaric species. The results confirmed the validity of 12 out of 13 nominal and all undescribed species. The nominal species, A. bosniensis is considered to be a junior synonym of A. heroldi, based on molecular and morphological analyses. Seven new species have been described: A. iapodicus, A. hirci, A. velebiticus, A. lossinii, A. drazinai, A. mandalinae, and A. busljetai. As a result, 19 nominal species of Illyrionethes are currently known from the Dinaric Karst. They grouped into three distinct lineages: strasseri-, heroldi- and magnus-lineage. All lineages follow a northwest-southeast direction of the Dinaric Karst and have overlapping distributions. The strasseri-lineage was thoroughly sampled and highly supported by all phylogenetic methods employed, so a detailed morphological analysis was performed. Novel morphological characters, specific body part ratios (length and hump ending point of male pereopod 7 carpus; length and concavity turning point male pleopod 1 exopod), are proposed for future species identifications.

• Keywords: 16S/špiljska fauna/COI/Histone 3/nove vrste/Oniscidea/kopneni jednakonožni rakovi/Trichoniscinae
• Keywords (english): 16S/cave fauna/COI/Histone 3/new species/Oniscidea/terrestrial isopods/Trichoniscinae
• Language: english
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:976009
• Study programme: Title: Biology; Study programme type: university; Study level: postgraduate; Academic / professional title: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje biologija (doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje biologija)
• Type of resource: Text
• File origin: Born digital
• Access conditions: Open access
• Repository: Repository of the Faculty of Science
• Created on: 2019-12-11 10:43:48